本尊の薬師如来は行基が彫刻したものと云われ、本堂の中には国分寺建立を指揮した聖武天皇と光明皇后の位牌が祀られています。また、弘法大師が唐から招来した仏と云われる烏瑟沙摩明王堂の明王は、眼と下半身の病気に霊険があるといわれ、トイレの神様として親しまれています。